Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tmem200cJ3QK46 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms