Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Taf4bG5E8Z2 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Taf4bG5E8Z2 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Taf4bG5E8Z2 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Taf4bG5E8Z2 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Taf4bG5E8Z2 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms