Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Ly6e-207ENSMUST00000187606 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Gm12906-201ENSMUST00000154610 441 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Gm5555-201ENSMUST00000120352 1111 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ScaperF8VQ70 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
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