Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

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Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Ifna11-201ENSMUST00000170428 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gm18391-201ENSMUST00000217189 658 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gm2663-201ENSMUST00000166306 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gm24466-201ENSMUST00000179978 109 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gm8725-201ENSMUST00000221829 1333 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gm8754-201ENSMUST00000118391 520 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gm25735-201ENSMUST00000175164 215 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gm43851-201ENSMUST00000200726 327 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Rassf6-205ENSMUST00000202704 1178 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 AC165249.1-203ENSMUST00000219976 392 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Olfr403-201ENSMUST00000076675 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Olfr43-201ENSMUST00000078936 1092 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Spats2l-206ENSMUST00000167085 3929 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Usp9yF8VPU6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
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