Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Vpreb3D3Z6J4 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 BC024978-201ENSMUST00000108379 7247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Smcr8-201ENSMUST00000056907 7391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Hivep2-205ENSMUST00000191138 9846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Vmn1r199-204ENSMUST00000227846 5523 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Arnt2-207ENSMUST00000208232 6047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Uvssa-201ENSMUST00000087864 7326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Nbr1-203ENSMUST00000103099 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Eya3-213ENSMUST00000180250 5020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Mgat4a-201ENSMUST00000042161 7030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Kalrn-212ENSMUST00000114973 5253 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 4932431P20Rik-202ENSMUST00000141713 9288 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Anapc1-201ENSMUST00000014499 8942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap19-201ENSMUST00000026150 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Dgkd-201ENSMUST00000027517 5695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 L3mbtl3-201ENSMUST00000040219 4572 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Vpreb3D3Z6J4 Polr1a-201ENSMUST00000055296 9216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms