Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 BC016548-202ENSMUST00000153797 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Brpf1B2RRD7 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms