Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 5033428I22Rik-204ENSMUST00000210633 6652 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pramef6A2A8M8 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms