Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm2A2A7B5 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm2A2A7B5 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm2A2A7B5 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm2A2A7B5 Cd9-ps-201ENSMUST00000174687 650 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm2A2A7B5 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm2A2A7B5 Gm34248-201ENSMUST00000200027 474 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm2A2A7B5 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm2A2A7B5 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm2A2A7B5 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm2A2A7B5 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm2A2A7B5 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm2A2A7B5 Gm13104-201ENSMUST00000119651 1446 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm2A2A7B5 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm2A2A7B5 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prdm2A2A7B5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Myl1-203ENSMUST00000120415 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Gm16894-201ENSMUST00000181756 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Gm29595-202ENSMUST00000187954 466 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Asgr1-202ENSMUST00000092959 1308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Gm46328-201ENSMUST00000217924 976 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 AC107711.4-201ENSMUST00000228948 440 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Sfi1-204ENSMUST00000118627 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Gm13842-202ENSMUST00000156331 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Ifna9-201ENSMUST00000102807 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Rian-210ENSMUST00000182689 295 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 Gm44236-201ENSMUST00000204492 513 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Prdm2A2A7B5 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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