Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 1700029B22Rik-202ENSMUST00000186532 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 AC110816.1-201ENSMUST00000218559 980 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 AC166256.1-201ENSMUST00000219081 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm36525-201ENSMUST00000222590 638 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 AC132881.1-201ENSMUST00000223780 1062 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Boll-201ENSMUST00000087585 882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Pdgfra-202ENSMUST00000168162 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Myf5-201ENSMUST00000000445 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Speer3W4VSP1 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Speer3W4VSP1 Arl14ep-202ENSMUST00000093883 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Speer3W4VSP1 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Dnhd1-201ENSMUST00000106776 1146 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Speer3W4VSP1 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Speer3W4VSP1 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Speer3W4VSP1 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Speer3W4VSP1 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Speer3W4VSP1 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Speer3W4VSP1 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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