Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Spata5-201ENSMUST00000029277 2890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Tjp1-201ENSMUST00000032729 6102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Gm17190V9GX38 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Gm17190V9GX38 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms