Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.75
Ilf3Q9Z1X4 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Dlec1-208ENSMUST00000165231 5263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ilf3Q9Z1X4 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms