Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Sema6cQ9WTM3 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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