Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TapbpQ9R233 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TapbpQ9R233 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TapbpQ9R233 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TapbpQ9R233 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TapbpQ9R233 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TapbpQ9R233 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TapbpQ9R233 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TapbpQ9R233 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TapbpQ9R233 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TapbpQ9R233 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TapbpQ9R233 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TapbpQ9R233 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TapbpQ9R233 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TapbpQ9R233 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TapbpQ9R233 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TapbpQ9R233 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TapbpQ9R233 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TapbpQ9R233 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TapbpQ9R233 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TapbpQ9R233 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TapbpQ9R233 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TapbpQ9R233 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TapbpQ9R233 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TapbpQ9R233 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TapbpQ9R233 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TapbpQ9R233 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TapbpQ9R233 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TapbpQ9R233 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TapbpQ9R233 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TapbpQ9R233 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TapbpQ9R233 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms