Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Oma1-201ENSMUST00000035780 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Klk6-201ENSMUST00000107966 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Vmn1r44-201ENSMUST00000089420 1108 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Rbfox1-202ENSMUST00000115841 1191 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm13376-201ENSMUST00000128743 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Csnk1eQ9JMK2 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms