Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm44421-201ENSMUST00000205064 1221 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Tlr5Q9JLF7 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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