Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Miga2-202ENSMUST00000100214 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Zmiz2-204ENSMUST00000109786 4319 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Ash2l-203ENSMUST00000110609 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Sept6-202ENSMUST00000060474 3457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Radil-202ENSMUST00000085758 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gm26751-201ENSMUST00000181218 4245 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Rap1gds1-201ENSMUST00000029796 3383 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gpr37-201ENSMUST00000054867 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gm32552-201ENSMUST00000217849 2291 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gm37731-201ENSMUST00000194545 2237 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Hnrnpc-201ENSMUST00000111610 2847 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Rad51d-201ENSMUST00000018985 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Ssrp1-209ENSMUST00000168266 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Slc26a1-202ENSMUST00000119270 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Slc26a1-204ENSMUST00000163328 3015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Heatr4-201ENSMUST00000164935 3038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Hsp90aa1-202ENSMUST00000094361 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Plod1-201ENSMUST00000019199 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gm45132-201ENSMUST00000207234 2542 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Ndst2-201ENSMUST00000047490 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Grik1-211ENSMUST00000228188 3221 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Zfp111-201ENSMUST00000056683 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Olfr1512-202ENSMUST00000214980 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Trem1Q9JKE2 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms