Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHS4

Clpx, ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit clpX-like, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpxQ9JHS4 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ClpxQ9JHS4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ClpxQ9JHS4 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ClpxQ9JHS4 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ClpxQ9JHS4 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ClpxQ9JHS4 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
ClpxQ9JHS4 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
ClpxQ9JHS4 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ClpxQ9JHS4 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ClpxQ9JHS4 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
ClpxQ9JHS4 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ClpxQ9JHS4 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
ClpxQ9JHS4 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
ClpxQ9JHS4 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ClpxQ9JHS4 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
ClpxQ9JHS4 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ClpxQ9JHS4 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
ClpxQ9JHS4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
ClpxQ9JHS4 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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