Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm15620-201ENSMUST00000122949 270 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm24791-201ENSMUST00000104284 131 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Olfr1432-201ENSMUST00000180978 930 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
OtofQ9ESF1 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
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