Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Rnft1Q9DCN7 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms