Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
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PrameQ9D4Z5 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
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PrameQ9D4Z5 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
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PrameQ9D4Z5 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
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PrameQ9D4Z5 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PrameQ9D4Z5 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PrameQ9D4Z5 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PrameQ9D4Z5 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PrameQ9D4Z5 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
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PrameQ9D4Z5 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PrameQ9D4Z5 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms