Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Gm29164-201ENSMUST00000185454 1024 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Mx2-202ENSMUST00000188251 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Gm44826-201ENSMUST00000207648 2332 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Snapc3Q9D2C9 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Snapc3Q9D2C9 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.3 ms