Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm44814-201ENSMUST00000207018 434 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gtf2e1Q9D0D5 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms