Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Use1Q9CQ56 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Use1Q9CQ56 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Use1Q9CQ56 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Use1Q9CQ56 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Use1Q9CQ56 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Use1Q9CQ56 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Use1Q9CQ56 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Use1Q9CQ56 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Use1Q9CQ56 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Use1Q9CQ56 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Use1Q9CQ56 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Use1Q9CQ56 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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