Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Ssxb1Q9CPU1 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Ssxb1Q9CPU1 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Ssxb1Q9CPU1 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Ssxb1Q9CPU1 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Ssxb1Q9CPU1 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Ssxb1Q9CPU1 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Ssxb1Q9CPU1 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Ssxb1Q9CPU1 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Ssxb1Q9CPU1 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ssxb1Q9CPU1 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ssxb1Q9CPU1 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ssxb1Q9CPU1 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ssxb1Q9CPU1 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ssxb1Q9CPU1 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssxb1Q9CPU1 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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