Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Krt88Q9CPR6 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
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Krt88Q9CPR6 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Krt88Q9CPR6 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Krt88Q9CPR6 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Krt88Q9CPR6 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Krt88Q9CPR6 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Krt88Q9CPR6 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Krt88Q9CPR6 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Krt88Q9CPR6 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Krt88Q9CPR6 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Krt88Q9CPR6 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Krt88Q9CPR6 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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