Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Tex29-204ENSMUST00000166638 561 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm30731-201ENSMUST00000203909 825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Fam114a2-202ENSMUST00000108850 1765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Pmp22-201ENSMUST00000018361 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rims1Q99NE5 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms