Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SrrtQ99MR6 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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