Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

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Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Usp16Q99LG0 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Usp16Q99LG0 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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