Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Hoxa1-201ENSMUST00000000964 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Sez6l-206ENSMUST00000212758 2664 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Tspan1Q99J59 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms