Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Smim11aQ99J19 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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Smim11aQ99J19 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Smim11aQ99J19 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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