Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDG5

Ppcs, Phosphopantothenate--cysteine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpcsQ8VDG5 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Mthfd1l-203ENSMUST00000120585 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PpcsQ8VDG5 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Rad51c-202ENSMUST00000067692 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Olfr1219-204ENSMUST00000215225 5865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Mid1-214ENSMUST00000163810 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PpcsQ8VDG5 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms