Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Ubxn4Q8VCH8 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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