Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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Top1mtQ8R4U6 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Top1mtQ8R4U6 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Top1mtQ8R4U6 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Top1mtQ8R4U6 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Top1mtQ8R4U6 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Top1mtQ8R4U6 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Top1mtQ8R4U6 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Top1mtQ8R4U6 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Top1mtQ8R4U6 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Top1mtQ8R4U6 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Top1mtQ8R4U6 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Top1mtQ8R4U6 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Top1mtQ8R4U6 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Top1mtQ8R4U6 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Top1mtQ8R4U6 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Top1mtQ8R4U6 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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