Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Vmn1r200Q8R281 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Vmn1r200Q8R281 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r200Q8R281 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r200Q8R281 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r200Q8R281 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r200Q8R281 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r200Q8R281 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r200Q8R281 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r200Q8R281 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r200Q8R281 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r200Q8R281 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r200Q8R281 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Vmn1r200Q8R281 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Vmn1r200Q8R281 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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