Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm6686-201ENSMUST00000178455 258 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm8525-201ENSMUST00000189674 861 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm43777-201ENSMUST00000197269 376 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Thy1-205ENSMUST00000215156 460 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Deup1-201ENSMUST00000045513 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm15258-201ENSMUST00000153801 741 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm9701-201ENSMUST00000077976 427 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Pgk1-rs7-201ENSMUST00000085735 1255 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm15015-201ENSMUST00000135491 636 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm16227-201ENSMUST00000160088 563 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Mt1-203ENSMUST00000212291 633 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 AC241616.1-201ENSMUST00000213741 166 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm6471-202ENSMUST00000148734 587 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hecw1Q8K4P8 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms