Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

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Length 1,038 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Znf628Q8CJ78 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Znf628Q8CJ78 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Znf628Q8CJ78 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Znf628Q8CJ78 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Znf628Q8CJ78 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Znf628Q8CJ78 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Znf628Q8CJ78 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Znf628Q8CJ78 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Znf628Q8CJ78 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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Znf628Q8CJ78 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Znf628Q8CJ78 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Znf628Q8CJ78 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms