Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Hpf1Q8CFE2 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hpf1Q8CFE2 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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