Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Oprm1-230ENSMUST00000154906 2039 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Zkscan6-201ENSMUST00000018491 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
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