Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ccdc113Q8C5T8 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ccdc113Q8C5T8 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ccdc113Q8C5T8 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ccdc113Q8C5T8 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ccdc113Q8C5T8 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ccdc113Q8C5T8 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ccdc113Q8C5T8 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ccdc113Q8C5T8 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Ccdc113Q8C5T8 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Ccdc113Q8C5T8 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Ccdc113Q8C5T8 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Ccdc113Q8C5T8 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Ccdc113Q8C5T8 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ccdc113Q8C5T8 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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