Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm26590-201ENSMUST00000180857 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 AI839979-201ENSMUST00000200738 654 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 AC091683.2-201ENSMUST00000222996 1185 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 AC192333.1-201ENSMUST00000224573 376 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 AC174647.1-201ENSMUST00000227419 1271 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Olfr205-201ENSMUST00000074125 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Olfr38-201ENSMUST00000074499 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm10717-203ENSMUST00000099051 639 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Zfp973-201ENSMUST00000108985 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Kcnj13-201ENSMUST00000113212 1270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trim35Q8C006 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trim35Q8C006 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 4933427D06Rik-202ENSMUST00000153517 522 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trim35Q8C006 Rpl22l1-206ENSMUST00000194649 525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trim35Q8C006 Il1f6-201ENSMUST00000028361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trim35Q8C006 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Mrps31-201ENSMUST00000033934 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Gm8050-201ENSMUST00000171987 1595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trim35Q8C006 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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