Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 4930555A03Rik-201ENSMUST00000196052 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Snx17Q8BVL3 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms