Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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Atg4dQ8BGV9 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Atg4dQ8BGV9 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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Atg4dQ8BGV9 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Atg4dQ8BGV9 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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Atg4dQ8BGV9 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Atg4dQ8BGV9 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Atg4dQ8BGV9 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Atg4dQ8BGV9 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Atg4dQ8BGV9 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Atg4dQ8BGV9 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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Atg4dQ8BGV9 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atg4dQ8BGV9 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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