Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Pcsk9Q80W65 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Pcsk9Q80W65 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
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Pcsk9Q80W65 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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Pcsk9Q80W65 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pcsk9Q80W65 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pcsk9Q80W65 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Pcsk9Q80W65 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Pcsk9Q80W65 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms