Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Pnma8aQ80VM8 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms