Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Rps23-ps1-201ENSMUST00000116115 425 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm14717-201ENSMUST00000140450 649 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Rps23-ps2-201ENSMUST00000146939 432 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm7242-201ENSMUST00000221134 705 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Mettl8-201ENSMUST00000090849 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Exosc9-201ENSMUST00000029269 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 4930509H03Rik-201ENSMUST00000196088 1215 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 2010204K13Rik-203ENSMUST00000150671 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm44236-201ENSMUST00000204492 513 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm14231-201ENSMUST00000120090 592 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 3110039M20Rik-201ENSMUST00000127041 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Mrps18b-201ENSMUST00000025305 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NischQ80TM9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 AC154197.1-201ENSMUST00000225136 1382 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm11465-201ENSMUST00000127942 435 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm15976-201ENSMUST00000129701 429 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Rhoc-205ENSMUST00000196817 877 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Kcne3-206ENSMUST00000207995 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NischQ80TM9 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms