Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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Dsg1bQ7TSF1 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
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Dsg1bQ7TSF1 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Dsg1bQ7TSF1 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Dsg1bQ7TSF1 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Dsg1bQ7TSF1 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Dsg1bQ7TSF1 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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Dsg1bQ7TSF1 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Dsg1bQ7TSF1 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms