Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm14055-201ENSMUST00000130262 668 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm37207-201ENSMUST00000194284 296 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chd4Q6PDQ2 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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