Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Polm-201ENSMUST00000020767 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Flna-201ENSMUST00000033699 8312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
CltbQ6IRU5 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms