Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Acacb-202ENSMUST00000102582 8788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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Tpm4Q6IRU2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Tpm4Q6IRU2 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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