Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm7525-201ENSMUST00000219425 454 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm23218-201ENSMUST00000158124 276 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Park2-210ENSMUST00000218435 865 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 D5Ertd615e-203ENSMUST00000198493 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Krt40Q6IFX3 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms